实验室动物房设施环境分为普通环境、屏障环境和隔离环境。无菌、已知菌以及无特殊病原体动物都需要在无菌或尽可能无菌的环境里饲养，这种环境，目前国际上通用称为屏障环境，即用一道屏障把动物与周围污染的环境隔开。

1、隔离环境：

该环境设施采用无菌隔离装置以保存无菌或无外来污染的动物，是在带有操作手套的容器中饲养动物的系统，用于饲养无菌动物和栖生动物。内部保持按微生物要求的100级的洁净度，但其设置的房间及操作人员不必按无菌室考虑。

2、屏障环境：

把10000～100000级左右的无菌洁净室作为饲养室，主要用于无特殊病原体动物的长期饲养和繁殖。该环境设施适用于饲育清洁实验动物及无特定病原体的实验动物，该环境严格控制人员、物品和环境空气的进出。

3、普通环境：

该环境设施符合动物居住的基本要求，但不能完全控制传染因子，适用于饲育教学等用途的普通级实验动物。是对人、物、空气等进出房间均不施行消除污染的系统，但通常要进行某种程度的清洁管理。

实验室动物房从功能间设置上主要包括人员的更衣间、动物饲养间、实验间、动物检验间、洁净物品存储间、清洗间、解剖间、饲料和垫料的存储间等，各功能间设置需齐全、合理。严格区分清洁区域和污染区域，以保证人和动物的健康，确保实验的准确性。

实验室动物房的工艺设计流向包括：实验人员、饲养人员和检疫人员的进入和退出路线;动物的进入和退出路线，解剖和废弃尸体的流向;动物用垫料和饲料的进出流向;笼器具进出流向;样品进出流向等。各种流向需要合理分流，避免交叉污染。

建筑材料：实验动物房的建筑墙板和顶棚的材料，可采用铝蜂窝的夹心彩钢板，圆弧角采用铝合金材质制成。地面采用PVC材质，耐酸碱，受损后易于修补。

空调系统：了保障实验动物房的洁净环境，实验动物房的空调系统采用初、中、高效三级过滤模式。换气次数根据实验室面积、高度和内部发热情况，通过空调的送风和排风实现。由于实验动物房是全空气系统，因此房间大小合理、紧凑即可，并设计合适的换气次数以保证洁净级别要求。另外，空调系统尽量考虑房间的四个角同时回风，以保证内部气流的均匀。